Refuge 42 est la confession de Chris, un jeune homme orphelin.
Il vit dans un abri souterrain que les habitants ne sont autorisés à quitter que la journée pour travailler, vivant tous sous le dictat des dures lois de l’Archimage, le dirigeant suprême auquel tout le monde obéit aveuglement.

Mais Chris diffère des autres : il est né Unique alors que ce monde ne comporte que des jumeaux.

Un jour, sa vie va changer brutalement. Car la loi de l’Archimage est formelle : tout Unique doit être mis à la disposition des Mages le 1er jour de sa seizième année.

Le déchirement de la séparation avec Gil, la jeune fille qu’il aime, le rend quasi fou de douleur et il part à contrecœur avec les Mages venus le chercher à peine minuit passé… Il assume son destin, il ne veut pas se retourner, il va de l’avant.

Mais tout tourne mal et il se retrouve embarqué dans une quête insensée pour se venger de l’Archimage et de ses lieutenants qui lui ont volé celle qu’il aime, son foyer, sa jeunesse…